PocketAnalyzerPCA

PocketAnalyzer^PCA ist eine Methode, der einen gitterbasierten Taschenerkennungsalgorithmus mit PCA und Clustering kombiniert, um die vorherrschenden Deformationsmodi von Bindungsstellen innerhalb eines Ensembles von Proteinstrukturen/Konformationen vorherzusagen. Die aus dieser Analyse abgeleiteten Eigenvektoren der Hauptkomponente (PC) und die zugehörigen Punktzahlen liefern eine Charakterisierung und Visualisierung der Konformationsverteilungen der Taschen, die zur Identifizierung relevanter Konformationen von Bindungsstellen in Proteinen verwendet werden können.

Die Software kann hier heruntergeladen werden.

Craig et al. J. Chem. Inf. Model. (2011)