Computergestützte Biochemie
Über
In der Arbeitsgruppe für computergestützte Biochemie unter der Leitung von Prof. Dr. Birgit Strodel arbeiten wir an der Entwicklung von biomolekularen Simulationsmethoden und deren Anwendung auf verschiedene Probleme aus den Bereichen Biophysik und Biochemie. Insbesondere kommen dabei Techniken der Molekulardynamik(MD)-Simulationen und des molekularen Dockings zur Anwendung. Die Simulationen werden häufig mittels Übergangsnetzwerken und Markov-Zustandsmodellen ausgewertet. Thematisch konzentrieren wir uns auf krankheitsverursachende Proteinaggregation, intrinsisch ungeordnete Proteine (IDPs), Protein-Lipid-Wechselwirkungen, Protein-Protein-Wechselwirkungen, Enzymdesign und Wirkstoffentwicklung
Forschungsthemen
- Amyloid-Aggregation
- Energielandschaften von IDPs und Peptidaggregation
- Protein-Membran-Interaktionen als Teil der Infektionsbiologie
- Enzymdesign: vom maschinellen Lernen zu MD-Simulationen und Experimenten
- Computergestütztes Wirkstoffdesign
- Kraftfeld-Verifizierung
- Methoden und Software-Entwicklung
Postdocs
Dr. Batuhan Kav
Dr. Hebah Fatafta
Dr. Maryam Olagunju
Ph.D. Students
Anna Jäckering
Mohammed Khaled
Jennifer Loschwitz
Lara Scharbert
Moritz Schäffler
Wibke Schumann
M.Sc. Students:
Bastian Aggeler
Bidisha Sarkar
Tilman Hoffbauer
B.Sc. Students:
Vera Grimmelt
Alexander Kaschkowski
Georg Pöppich